Il test Bio-molecolare basato sull'identificazione di RNA virale dai Tamponi naso-oro-faringei tramite tecnica RT-PCR è l'unico metodo definitivamente diagnostico, come da Circolare Ministeriale 09/03/2020 e successive modifiche. Il tampone oro-faringeo e nasale è una procedura che consiste nel prelievo delle cellule superficiali della mucosa della faringe posteriore o del rinofaringe. Il prelievo viene eseguito in pochi secondi ed ha un'invasività minima, originando al più un impercettibile fastidio nel punto di contatto. La semplicità del prelievo non significa però che possa essere eseguito da chiunque, ma da personale addestrato e specializzato che deve garantire la corretta esecuzione della procedura evitando sia la contaminazione del campione, che la raccolta solo del tratto più esterno e superficiale delle mucose, procedura che inficerebbe il risultato del test molecolare.